饮用连花清瘟后，一般不能饮用藿香正气水，主要是因为两者适应证不同，应根据身体症状服药，不得滥用药物。连花清瘟有助于清瘟解毒，具有宣肺排热的功效。一般可用于治疗流感，如热毒袭肺证。如有发热或高烧、恶寒、鼻塞、咳嗽、咽痛等症状，可在专业医生指导下用药。通常，感冒的人不应该使用它。

藿香正气水能解表化湿，具有理气化中的功效。通常适用于外感寒冷、夏伤夏湿引起的感冒，如头痛或胸闷、呕吐、腹胀等。虽然两者的成分不会发生冲突，但治疗方向不同，所以连花清瘟后一般不能喝藿香正气水。若身体出现异常症状，必要时需就医，在专业医生的指导下选择合适的药物治疗，不要乱用药物。