男性精子畸形率高，可能是不良生活习惯、精索静脉曲张、生殖系统感染、长期服用药物等原因导致。建议及时到医院就诊，明确具体原因后进行针对性治疗。

1、不良生活习惯：如果经常吸烟、酗酒，或者是长时间处于高温环境中，都可能会对精子产生影响，从而出现精子畸形的情况。此时需要改善不良的生活习惯，避免长时间处于高温环境中，并且要戒烟、戒酒；

2、精索静脉曲张：通常与静脉回流障碍有关，会导致睾丸局部的血液循环受阻，使睾丸内的温度升高，从而影响到精子的质量，出现精子畸形的情况。可以遵医嘱口服迈之灵片等药物进行治疗；

3、生殖系统感染：比如附睾炎或者睾丸炎，会导致附睾以及睾丸组织受到损伤，引起局部充血和肿胀的症状，还可能会伴有疼痛感，在炎症的刺激下也会影响到精子的质量，出现精子畸形的情况。可以遵医嘱口服阿莫西林胶囊或者头孢克肟片等药物进行治疗；

4、长期服用药物：如果长期服用抗肿瘤类药物或者抗精神病类药物，可能会影响体内激素水平的变化，从而影响到精子的质量，导致精子畸形率增高。一般在停药以后会逐渐恢复。

如果存在染色体异常的情况，则可能导致胚胎发育异常或停止发育等情况发生。