精子畸形不育的检查主要包括精液常规检查、染色体检查、基因检测等，通过这些检查可以明确导致精子畸形不育的原因。

1.精液常规检查：精液常规检查是男性不育症的常规检查项目之一，包括精子密度、精子活力、精子形态学分析等。如果发现精子密度低于正常值，或者精子活力低下，甚至出现死精的情况，则提示可能存在精子畸形不育的情况。

2.染色体检查：染色体异常也是导致精子畸形不育的重要原因之一，因此可以通过染色体检查来排除这一可能性。染色体检查主要是通过抽取外周血进行化验，然后将细胞核内的DNA提取出来进行分析，从而判断是否存在染色体异常的情况。

3.基因检测：基因检测是指通过分子生物学技术对人类遗传物质DNA进行检测的一种方法。如果发现存在某些基因突变或者缺失的情况，则可能会导致精子畸形不育的发生。

除了上述检查外，还可以进行内分泌功能检查、抗精子抗体检查等。建议患者及时就医，在医生指导下进行相关检查，以明确病因并进行针对性治疗。